W 2005 roku założył pracownię Bjarke Ingels Group. Pierwsze biuro otwarte zostało w Kopenhadze, kolejne w Nowym Jorku (2010), Londynie (2016) i Barcelonie (2019). W 2005 roku ukończył szpital psychiatryczny w Helsingør, zaprojektowany na wzór płatka śniegu. W 2008 podczas World Architecture Festival w Barcelonie jego projekt Mountain Dwellings został ogłoszony najlepszym projektem kompleksu mieszkalnego. Mountain Dwellings to kompleks 80 mieszkań wybudowanych nad zabudowanym, wielopoziomowym parkingiem. Mieszkania ułożone są blokami stopniowo do góry, tworząc sztuczny „stok”. Na dachach znajdują się tarasy i ogródki dachowe.
W 2007 wygrał przetarg na projekt nowego Duńskiego Muzeum Morskiego w Helsingør, które wcześniej znajdowało się w zamku Kronborg, wpisanym na Listę Światowego Dziedzictwa UNESCO. Muzeum zostało zaprojektowane w dawnym suchym doku na podziemnej powierzchni 7,600 tysięcy metrów kwadratowych. Budowę rozpoczęto w 2010 i ukończono trzy lata później.