Inne schorzenia często spotykane u owczarków niemieckich: dysplazja stawów łokciowych (nieleczone zwyrodnienia stawów i kulawizny mogą prowadzić do niepełnosprawności) mielopatia zwyrodnieniowa (prowadzi do całkowitej utraty możliwości ruchu na skutek degeneracji nerwów) zewnątrzwydzielnicza niewydolność trzustki (może dotyczyć 18% populacji owczarków) karłowatość przysadkowa (pies rośnie wolniej lub przestaje rosnąć w ogóle) defekt genu MDR1 (powoduje nadwrażliwość na część leków weterynaryjnych) choroba von Willebranda (skaza krwotoczna) hiperurykozuria (powoduje ból, problemy z oddawaniem moczu oraz nawracające stany zapalne dróg moczowych) przerost gruczołu krokowego (prostaty) zmiany alergiczne gnilec psy tej rasy przejawiają średnie ryzyko do wystąpienia skrętu żołądka enostoza – młodzieńcze zapalenie kości nowotwory alergie pokarmowe padaczka idiopatyczna. Rasa wykazuje też silną predyspozycję do dwóch schorzeń o podłożu immunologicznym. Przetoki okołoodbytowe dotyczą niemal wyłącznie tej rasy — szacuje się, że owczarki niemieckie stanowią nawet 80–84% wszystkich rozpoznawanych przypadków, co wiąże się prawdopodobnie ze zwiększoną gęstością gruczołów potowych apokrynowych w tej okolicy ciała.