Komisja współdziała z Najwyższą Izbą Kontroli, Komisjami Sejmowymi, Sądem Najwyższym, Prokuraturą Polskiej Rzeczypospolitej Ludowej, Naczelnym Sądem Administracyjnym, Państwowym Arbitrażem Gospodarczym oraz z innymi instytucjami powołanymi do umacniania praworządności i przestrzegania porządku publicznego oraz ochrony praw obywateli.
Kierowanie Komisją Na czele Komisji stał przewodniczący, powołany przez Prezesa Rady Ministrów.
W skład Komisji wchodzili powołani przez Prezesa Rady Ministrów na wniosek Przewodniczącego Komisji, uzgodniony z kierownikami właściwych organów państwowych i instytucji – ich zastępcy (przedstawiciele) reprezentujący: Najwyższą Izbę Kontroli, Sąd Najwyższy, Prokuraturę Polskiej Rzeczypospolitej Ludowej, Naczelny Sąd Administracyjny, Państwowy Arbitraż Gospodarczy, Ministra Sprawiedliwości, Ministra Spraw Wewnętrznych, Ministra Obrony Narodowej, Ministra Administracji, Ministra Gospodarki Terenowej i Ochrony Środowiska, Ministra Pracy, Płac i Spraw Socjalnych, Ministra Finansów, Ministra Komunikacji, Ministra – Członka Rady Ministrów do Spraw Współpracy ze Związkami Zawodowymi.