Broń podwodną stanowiło pięć stałych nadwodnych wyrzutni torped, w tym dwie na dziobie i po jednej w każdej z burt i na rufieTak według , natomiast błędnie podaje, że dziobowe wyrzutnie torped były podwodne. Dostępne źródła nie podają kalibru wyrzutni torped. Według , hiszpańska marynarka w 1905 roku używała niemieckich torped Schwartzkopff 14-calowych (350 mm) i 18-calowych (450 mm). Według rysunku z epoki (powyżej), wyloty dziobowych wyrzutni torped skierowanych do przodu znajdowały się na dziobie po obu burtach tuż nad linią wodną. „Lepanto” był uzbrojony już tylko w dwie wyrzutnie torped.
Opancerzenie Opancerzenie okrętu obejmowało przede wszystkim typowy dla krążowników pancernopokładowych wewnętrzny pokład pancerny z bocznymi skosami. W środkowej poziomej części, znajdującej się nad linią wodną, miał on na większości długości grubość 51 mm (lub według innych danych 25 mm). Skosy pokładu schodziły do burt, na 1,8 m poniżej linii wodnej i miały na większości długości grubość 76 mm.