Przygotowania do operacji Mimo informacji wywiadowczych od Amerykanów i potwierdzenia nazwy jednostki Szef Sztabu Generalnego Sił Obronnych Izraela ppłk Sza’ul Mofaz nie był pewny, czy należy zarekomendować przeprowadzenie operacji premierowi i ministrowi obrony. Gazeta „Ha-Arec” podała, że Mofaz miał odbyć lot zwiadowczy nad jednostką w celu osobistego potwierdzenia ewentualnego celu operacji. Z kolei Bochbot podał, że Mofaz nakazał sfotografowanie statku z powietrza. Na zdjęciach lotniczych zidentyfikowano i potwierdzono nazwę jednostki.
Zdecydowano się, że do przechwycenia „Karine A” dojdzie na Morzu Czerwonym. Wymagało to jednak zaangażowania większej ilości środków. Od czasu wycofania się izraelskich sił z Synaju, wszystkie duże okręty wojenne zostały przebazowane na Morze Śródziemne. W Ejlacie pozostały okręty patrolowe typu Dwora, zbyt małe, aby służyć jako jednostki transportujące łodzie desantowe. Ponadto okręty patrolowe tego typu mogłyby maksymalnie wziąć udział w operacji mającej miejsce do 220 km od Ejlatu. Innym problemem była także duża ilość postronnych statków, które mogłyby znaleźć się w obszarze operacji. Okręty typu Dwora były jednak jedynymi izraelskimi jednostkami o odpowiednim potencjale bojowym w Zatoce Akaba.