Po zawieszeniu broni wieczorem utknął na mieliźnie obok duńskiego fortu Trekroner, lecz nie był już ostrzeliwany i później z niej zszedł. Do lipca służył w dalszym toku kampanii bałtyckiej jako flagowiec Nelsona na przemian z trójpokładowym HMS „Saint George”, przy tym 23 maja kotwiczył na Zatoce Gdańskiej. Od grudnia 1801 roku jego kapitanem był kmdr George Dundas.
W 1803 roku „Elephant” uczestniczył w blokadzie sił francuskich na wyspie San Domingo. W lipcu ścigał i walczył z francuskim okrętem liniowym „Duguay-Trouin” (nominalnie 74-działowym), lecz wycofał się po nadpłynięciu francuskiej fregaty. W 1807 roku okręt powrócił do Anglii na remont, powracając do służby w kwietniu 1811 roku. Kapitanem był wówczas kmdr Francis Austen. Do maja 1814 roku działał na wodach europejskich, zwalczając francuskich i amerykańskich korsarzy, po czym został wycofany do rezerwy.