Tylko medresa Jawhar al-Qanqaba’i zachowała w pełni swoją początkową formę i dekoracje z tamtych czasów. Meczet posiadał swoją kuchnię, w której przygotowywano posiłki dla biednej ludności kairskiej, jak i dla przybyszy z innych krajów. Przez te wszystkie lata w meczecie nauczano różnych szkół prawa muzułmańskiego, w tym ze szkoły szafi’ickiej czy hanafickiej. Już pod koniec XVI wieku, al-Azhar zaczęto nazywać jednym z 5 najważniejszych meczetów na świecie. W tym gronie znalazły się także meczety z: Mekki, Medyny, Jerozolimy i Damaszku. Meczet był również między innymi miejscem, gdzie odbywały się protesty przeciwko okrucieństwu okupacji francuskiej z 1798 roku. Meczet al-Azhar jest najstarszym zachowanym zabytkiem, który powstał za panowania Fatymidów w Egipcie.

Architektura mały|Stępkowe łuki fasady dziedzińca zdobione stiukiem.mały|Brama Sułtana Kajtbaja. mały|lewo|Bab al-Muzajinin. Pierwotnie meczet opierał się na planie prostokąta, a jego sala modlitewna posiadała pięć naw ustawionych równolegle do ściany kibli. Architektonicznie posiada wiele cech wspólnych z północnoafrykańską tradycją architektury Fatymidów. Jako przykład można podać układ naw bocznych, wejście oraz salę modlitewną.