Bacteroides fragilis – beztlenowa Gram-ujemna bakteria o kształcie pałeczki.
Morfologia B. fragilis jest pałeczką pleomorficzną pod względem wielkości i kształtu. Jej wielkość mieści się w zakresie 0,5-1,5 × 1,0–6,0 μm. B. fragilis jest bakterią Gram-ujemną i nie posiada wici ani rzęsek, co czyni ją nieruchomą. Wykorzystuje za to fimbrie i polisacharydową otoczkę do adhezji do komórek organizmu człowieka (w odróżnieniu od lipopolisacharydu (LPS) tlenowych Gram-ujemnych pałeczek, LPS cechuje się brakiem lub niską aktywnością endotoksyczną).
Mechanizmy zjadliwości Dzięki wytwarzaniu polisacharydowej otoczki bakterie mogą wiązać się z powierzchnią otrzewnej oraz są chronione przed byciem sfagocytowanym przez komórki układu odpornościowego. Ochronę zapewniają im również produkowane przez nie podczas metabolizmu anaerobowego krótkołańcuchowe kwasy tłuszczowe (np. bursztynian).
Wywołujące biegunkę enterotoksykogenne szczepy B. fragilis wytwarzają ciepłochwiejną toksynę BF (metaloproteinazę cynkową). Jej aktywność prowadzi do zmian morfologicznych w nabłonku jelita poprzez rearanżację włókien F-aktyny, co stymuluje komórki nabłonka do sekrecji chlorków i wody do światła jelita.