Pijani rosyjscy żołnierze splądrowali plebanię, obracając ją w ruinę. Wówczas uległ zniszczeniu dorobek jego wieloletniej pracy, rękopis obszernej pracy naukowej o historii Bartoszyc.
Ks. Ziegler został uwięziony przez gestapowców, którzy zapowiedzieli jego rozstrzelanie kolejnego dnia o godzinie czwartej rano. O poranku zmieniono jednak decyzję i został wysłany transportem kolejowym w nieludzkich warunkach do obozu pracy na Syberię. 11 marca 1945 zmarł z głodu i wycieńczenia organizmu. Jego zwłoki, po zabraniu wszystkich wartościowych przedmiotów przez rosyjskich żołnierzy, zostały zakopane przy torach kolejowych. W ostatnich słowach prosił współtowarzyszy tragedii o poinformowanie bliskich o jego losie i śmierci.
Kościół katolicki czci go współcześnie jako męczennika za wiarę.