Modele matematyczne tworzone w ramach badań oraz metody ich analizy pozwalały stawiać i wstępnie testować hipotezy o biochemicznych mechanizmach regulacyjnych w żywych komórkach, co z jednej strony może pomóc w określeniu wzajemnych interakcji pomiędzy różnymi typami terapii, a z drugiej stanowić pierwszy etap w poszukiwaniu potencjalnych celów molekularnych dla nowych terapii.
Osobny obszar badań, prowadzonych przez profesora Śmieję stanowi wykorzystanie metod sztucznej inteligencji w planowaniu zadań i rozwiązywaniu problemów transportowychAdam Gałuszka, Eryka Probierz, Tomasz Grzejszczak, Marek Harasny, Marcin Wolak, Rafał Kaern, Jarosław Śmieja, AdBlue distribution as a VRP problem with constraints on the capacity of trucks and suppliers’ requests on the example of a selected distribution system in Poland W: Modelling and simulation'2022. The 2022 European Simulation and Modelling Conference, October 26-28, 2022, Porto, Portugal / Praça Isabel, Maia Eva, Geril Philippe (red.), 2022, Ostend, EUROSIS-ETI, s. 201–204, ..