W 1954 roku odmówiono o. Hoade wjazdu na teren izraelskiej części Jerozolimy. 6 grudnia 1956 został wydalony z kraju przez władze jordańskie jako persona non grata. Przez Bejrut franciszkanin trafił do Rzymu. Jordańczycy nigdy nie podali oficjalnego powodu wydalenia. W Rzymie o. Hoade zamieszkał najpierw w irlandzkim Kolegium św. Izydora (), następnie został penitencjarzem w Bazylice św. Jana na Lateranie. Był konsultorem Kongregacji Kościołów Wschodnich i doradcą kardynała Grzegorza Piotra Agadżaniana podczas Soboru Watykańskiego II. Uczestniczył w planowaniu podróży apostolskiej Pawła VI do Ziemi Świętej w 1964 roku. Ojciec Eugene Hoade zmarł w Rzymie 17 marca 1972 roku. Został pochowany w kwaterze franciszkanów na Campo Verano.
Publikacje 1936 – Miri and Amiri. Mulk and Mamluk: Legal notes on state lands and private lands in Palestine, Tipografia di N.S.