Po przewrocie Dagalo stopniowo umocnił swoją władzę, zawiązując umowy cywilno-wojskowe, między innymi z Arabią Saudyjską. Z jego inicjatywy doszło do masakry w Chartumie 3 czerwca 2019 r., w której zginęło około 100 demonstrantów, a setki zostało rannych. Podczas gdy al-Bashir i inni czołowi sudańscy urzędnicy zostali oskarżeni przez Międzynarodowy Trybunał Karny o ludobójstwo i zbrodnie przeciwko ludzkości, Dagalo nie postawiono żadnych zarzutów, pomimo oskarżeń grup praw człowieka o zbrodnie wojenne popełnione przez siły, którym przewodził przez ostatnią dekadę. Przez lata Dagalo zbudował silne więzi zarówno w regionie, jak i na arenie międzynarodowej. Wysłał siły RSF do walki z rebeliantami powiązanymi z Iranem w Jemenie, sprzymierzając się z Arabią Saudyjską i Zjednoczonymi Emiratami Arabskimi, którzy finansowali jego działalność. Spotykał się też z zachodnimi ambasadorami, prowadził rozmowy z ugrupowaniami rebeliantów, zaprowadzał pokój między walczącymi plemionami i publicznie mówił o znaczeniu demokracji w Sudanie, nie ukrywając niechęci do armii. Mohamed Hamdan Dagalo kierował rządowym zespołem negocjacyjnym z ruchami rebeliantów w Dżubie.