Średnie roczne temperatury w parku wahają się od +25 °C do +30 °C.
Flora W parku odnotowano 46 gatunków mchów, 83 gatunki porostów, 43 gatunki wątrobowców, 85 gatunków makroglonów morskich i 508 gatunków roślin zielonych. Rośnie tu m.in.: Podocarpus guatemalensis spotykany zwykle w lasach mglistych na dużych wysokościach czy Caryodaphnopsis theobromifolia występująca tylko, oprócz Gorgony, w okolicach rzeki Palenque w Ekwadorze.
Fauna Na wyspach zarejestrowano m.in. 14 gatunków płazów, 56 gatunków gadów, 148 gatunków ptaków.
Występuje tu wiele gatunków endemicznych takich jak m.in.: narażona na wyginięcie (VU) kapucynka czarno-biała z podgatunku Cebus capuccinus curtus, leniwiec pstry z podgatunku Bradypus variegatus gorgon, kolczakowiec środkowoamerykański z podgatunku Proechimys semispinosus gorgonae, jaszczurka z gatunku Anolis gorgonae, ślimak z gatunku Dyrmaeus gorgonensis, krab z gatunku Hypobolocera gorgonensis, skorpion z gatunku Ananteris gorgonae, chronka plamista z podgatunku Thamnophilus punctatus gorgonae, błękitniczek czerwononogi z podgatunku Cyanerpes cyaeneus gigas, cukrzyk z podgatunku Coereba flaveola gorgonae.