Autorskie A Rural Economy in Transition: Asia Minor from Late Antiquity into the Early Middle Ages, Fundacja im. Rafała Taubenschlaga, Warszawa 2013. Średniowieczni Rzymianie i przyroda. Interdyscyplinarna historia środowiskowa, Towarzystwo Wydawnicze „Historia Iagellonica”, Kraków 2018. Poprawione wydanie niemieckie: Ein vormoderner Staat als sozioökologisches System. Das Oströmische Reich 300–1300 n. Chr., tłum. Jakub Sawicki, Sandstein, Drezno 2021.
Redagowane (z Adamem Gendźwiłłem i Elżbietą Sroczyńską) Przemiany mentalności w kulturach starożytnych, Wydawnictwo Poznańskie, Poznań 2005. (z Rafałem Matuszewskim i Przemysławem Piwowarczykiem) Religie w świecie antycznym, Wydawnictwo Poznańskie, Poznań 2007. (z Damianem Jasińskim) Cultures in Motion: Studies in the Medieval and Early Modern Periods, Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, Kraków 2014. (z Rafałem Szmytką) Ekobiografia Krakowa, Znak Horyzont, Kraków 2018. Poprawione wydanie angielskie: Krakow: An Ecobiography, tłum.