Podział na koszyki Uwaga: Losowanie III rundy kwalifikacyjnej odbyło się przed zakończeniem II rundy kwalifikacyjnej, więc rozstawienia dokonano przyjmując założenie, że awans uzyska drużyna z najwyższym współczynnikiem w poprzedniej rundzie. W przypadku awansu, którejś z drużyn nierozstawionej, w III rundzie przejmuje ona współczynnik najwyżej rozstawionego rywala.
Oznaczenia: Drużyny, które awansowały z II rundy eliminacyjnej zachowując swój współczynnik.
Drużyny, które zaczęły rywalizację od III rundy eliminacyjnej.
Drużyny, które awansowały z II rundy eliminacyjnej, przejmując współczynnik rywala.
Grupa 1 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Partizan Belgrad25.500 Maccabi Tel Awiw24.000 Rapid Wiedeń18.500 Sepsi OSK13.000 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. AEK Larnaka10.000 Debreceni VSC8.000 Sabah Baku6.500 Aktöbe FK3.500
Grupa 2 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. AZ Alkmaar47.500 PAOK FC25.000 Beşiktaş JK14.000 NK Celje11.243 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Hajduk Split9.000 Neftçi PFK9.000 FC Santa Coloma7.500 Nioman Grodno2.500
Grupa 3 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Dynamo Kijów35.000 FC Midtjylland25.500 Hapoel Beer Szewa17.000 Legia Warszawa11.000 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Omonia Nikozja10.000 Lewski Sofia7.000 Aris FC7.000 Austria Wiedeń6.800