Zwycięzcy rywalizacji awansowali do finału, natomiast przegrani grali w meczu o 3. miejsce. Faza III: o 3. miejsce: w rywalizacji zagrały kluby, które przegrały swoje rywalizacje w półfinale. Rywalizacja toczyła się systemem mecz i rewanż. Zwycięzca rywalizacji zajęła 3. miejsce w klasyfikacji końcowej. Finał: w finale zagrały kluby, które wygrały swoje rywalizacje w półfinale. Rywalizacja toczyła się do trzech zwycięstw. Zwycięzca rywalizacji awansował do Polskiej Ligi Koszykówki 2013/2014.
Nagrody Kluby, które zajmą trzy pierwsze miejsca otrzymają puchary i nagrody finansowe w wysokości: za 1. miejsce – 15.000 zł za 2. miejsce – 10.000 zł za 3. miejsce – 5.000 zł
Natomiast zawodnicy i trenerzy tych klubów otrzymają pamiątkowe medale, odpowiednio złote, srebrne i brązowe.
Kluby
Astoria Bydgoszcz AZS Politechnika Poznań AZS Radex Szczecin AZS WSGK Kutno MKS Dąbrowa Górnicza MOSiR Krosno PC SIDEn Toruń Polonia Przemyśl SKK Siedlce Sokół Łańcut Spójnia Stargard Szczeciński Stal Ostrów Wielkopolski Start Lublin UMKS Kielce WKS Śląsk Wrocław Znicz Basket Pruszków
Sezon zasadniczy Tabela końcowa