Po mianowaniu go diecezjalnym duszpasterzem osób niepełnosprawnych, został przeniesiony do Borowej Wsi, gdzie w 1990 roku utworzony został Ośrodek dla Osób Niepełnosprawnych „Miłosierdzie Boże”. W kolejnych latach ks. Bąk zaangażowany był w powstawanie podobnych placówek w Rudzie Śląskiej, Knurowie, Tychach, Lędzinach, Chorzowie i Wodzisławiu Śląskim.
W 1999 ks. Bąk ukończył studia podyplomowe na Wydziale Nauk Społecznych Uniwersytetu Śląskiego na kierunku Organizacja Pomocy Społecznej. Jednocześnie organizując pomoc osobom niepełnosprawnym w strukturach archidiecezji katowickiej, ks. Bąk odbył studia doktoranckie na Papieskiej Akademii Teologicznej w Krakowie, zakończone w 2008 roku obroną pracy doktorskiej Pomoc Caritas Archidiecezji Katowickiej ludziom potrzebującym oraz poszkodowanym w katastrofach na Śląsku w latach 2000-2007, napisanej pod kierunkiem ks. prof. Alojzego Drożdża.
W latach 2000–2019 był dyrektorem Caritas Archidiecezji Katowickiej.
W roku 1995 ks. Bąk został kanonikiem honorowym Katowickiej Kapituły Katedralnej. W 2007 roku otrzymał godność kapelana honorowego Jego Świątobliwości. W 2010 roku Rada Powiatu Bieruńsko-Lędzińskiego nadała ks. Bąkowi tytuł „Honorowego Obywatela Powiatu Bieruńsko-Lędzińskiego”. Od 28 listopada 2013 roku jest też honorowym obywatelem Rudy Śląskiej.