Reżyser Yūji Suzuki zmarł 9 września 2021, przed zakończeniem emisji serialu. Chociaż pracował w branży jako kluczowy animator i reżyser odcinków od połowy 2000 roku, Edens Zero było pierwszym i jedynym serialem w pełni przez niego wyreżyserowanym.
9 lutego 2022 ogłoszono, że serial otrzyma drugi sezon. Toshinori Watanabe zastąpił Suzukiego na stanowisku reżysera. Emisja rozpoczęła się 2 kwietnia i zakończyła 1 października 2023. Licencję na dystrybucję serii w wybranych regionach posiada Crunchyroll. 72-minutowy film podsumowujący wydarzenia z pierwszego sezonu został wyemitowany w Japonii tego samego dnia co pierwszy odcinek drugiego sezonu. Prawa do jego dystrybucji zakupił Crunchyroll. W Polsce sezon ten jest emitowany na antenie 2x2 TV od 24 czerwca 2023, a od marca 2026 nadawany jest również w stacji Pixel TV. 30 marca 2026 film kompilacyjny oraz drugi sezon zostały także udostępnione w serwisie Animation Digital Network w wersji z polskimi napisami.
Ścieżka dźwiękowa NrTytułWykonawcyŹródłoCzołówka1„Eden Through the Rough”Takanori Nishikawa2„Forever”L’Arc-en-Ciel3„Never say Never”Takanori Nishikawa4„Kaibutsu”Tani YuukiNapisy końcowe1„Bōken no Vlog”CHiCO with HoneyWorks2„Sekai no Himitsu”Sayuri3„Rinne”Asca4„my star”Lozareena