W 2022 roku został doktorem habilitowanym (stopień nadał mu Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu).
W latach 2015–2018 pracował (w ramach stażu podoktorskiego) na Uniwersytecie Stanu Pensylwania, w 2018 roku został zatrudniony na Uniwersytecie Marylandu w College Park, a w 2022 roku na Uniwersytecie Jagiellońskim w Krakowie, w Centrum Zaawansowanych Badań Matematycznych.
Publikacje i osiągnięcia Autor ponad 30 artykułów naukowych. Swoje prace publikował m.in. w „Ergodic Theory and Dynamical Systems”, „Journal of Modern Dynamics”, „Communications in Mathematical Physics", „Duke Mathematical Journal” i najbardziej prestiżowych czasopismach matematycznych świata: „Annals of Mathematics”, „Journal of the American Mathematical Society”, „Inventiones Mathematicae”.
Zainteresowania naukowe Kanigowskiego skupiają się wokół układów dynamicznych i teorii ergodycznej oraz ich związków z teorią liczb, geometrią i teorią prawdopodobieństwa. W szczególności bada on losowość i chaos w gładkich układach dynamicznych, problemy klasyfikacyjne w abstrakcyjnej teorii ergodycznej oraz niestandardowe twierdzenia ergodyczne, które znajdują zastosowanie w teorii liczb. Razem ze współautorami z powodzeniem rozwiązał m.in.