W związku z planowaną na sezon 2008/2009 reorganizacją rozgrywek zwycięzcy każdej z grup (w przypadku województw z dwoma grupami zwycięzcy barażów pomiędzy triumfatorami poszczególnych grup w tych województwach) utworzyli osiem par barażowych, w których wygrana była premiowana awansem do nowo utworzonej II ligi (ówczesna III liga). Zespoły, które przegrały w barażach i te, które zajęły czołowe miejsca w końcowej tabeli, uzyskały prawo gry w sezonie 2008/2009 w nowo utworzonej III lidze (ówczesna IV liga). Pozostałe drużyny spadły do nowo utworzonej IV ligi (ówczesna klasa okręgowa bądź V liga).
W sezonie 2016/2017 nastąpiła reforma III ligi. Utworzono cztery grupy po 18 zespołów. Podział na województwa jest taki sam jak w przypadku dawnej III ligi (obecnie II liga) istniejącej do 2008 roku.
Do kolejnych znaczących zmian doszło przed rozpoczęciem sezonu 2024/2025. Wprowadzono dodatkowe baraże o awans do II ligi dla wicemistrzów wszystkich grup. Ponadto, zwiększono liczbę spadkowiczów z 3 do 4 (w przypadku spadku drużyn z II ligi do danej grupy III ligi liczba spadkowiczów dodatkowo wzrasta), co jest spowodowane wprowadzeniem baraży o awans dla wicemistrzów wszystkich grup IV ligi.
Podział na grupy