Praca naukowo-dydaktyczna Tematyka badawcza profesora Edwarda Kołakowskiego obejmuje technologię żywności ze szczególnym uwzględnieniem żywności pochodzenia morskiego. Opublikował ponad 200 prac naukowych, w tym 4 książki naukowe; jest współautorem 32 patentów. W latach 1980–1987 uczestniczył w 3 wyprawach antarktycznych Polskiej Akademii Nauk (w tym dwie wyprawy całoroczne) do Polskiej Stacji Antarktycznej im. H. Arctowskiego na Wyspie Króla Jerzego, gdzie prowadził badania dotyczące biochemii i wykorzystania kryla do celów żywnościowych. Był kierownikiem X jubileuszowej wyprawy. Brał udział w trzech antarktycznych rejsach doświadczalno-wdrożeniowych na statkach rybackichJubileusz 70-lecia Wydziału Nauk o Żywności i Rybactwa. Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie, Szczecin 2022, s.99. Odbył kilkumiesięczne staże naukowe w Jugosławii (1961), Norwegii (1966), Szkocji (1976). Wyjeżdżał na sympozja naukowe, wystawy specjalistyczne, wykłady oraz jako ekspert do Niemiec, Szwecji, Holandii, Danii, Japonii, Włoch, Wielkiej Brytanii, ZSRR, Indii. Prowadził wykłady dla studentów z przedmiotów technologia rybna, ogólna technologia żywności oraz z przedmiotów specjalistycznych na studiach podyplomowych.