Garwood dokonali na łamach „Papers in Palaeontology” redeskrypcji taksonu dzięki wykorzystaniu nieużytych przez wcześniejszych autorów technik – obrazowania z przekształceniem odbicia (RTI) oraz rentgenowskiej mikrotomografii komputerowej.
Autorzy oryginalnego opisu uznali Palaeopycnogonides za przypuszczalnego przedstawiciela rodziny Ammotheidae, odpowiadającej Ascorhynchoidea w klasyfikacji Rogera Bambera, wskazując jednak także na podobieństwa z Pycnogonidae z nadrodziny Pycnogonoidea. W 2007 roku Bamber zaklasyfikował omawiany rodzaj do podrodziny Palaeoendeinae z rodziny Endeidae w obrębie Phoxichilidoidea, sugerując nawet że Palaeopycnogonides może być synonimem Palaeoendeis. W 2023 roku Sabroux i inni zreinterpretowali niektóre struktury opisane przez Charbonniera i innych oraz zdecydowali się na utworzenie dla Palaeopycnogonides nowej, monotypowej rodziny Palaeopycnogonidae w obrębie rzędu Pantopoda. Jako możliwych bliskich krewnych tejże wskazali oni Pycnogonidae, Endeidae lub rodzaj Queubus.