Systemy Akwizycji danych w 3D ECT thumb|System pomiarowy – Tomograf pojemnościowy z podłączoną 16-elektrodową sondą Tomograficzny system pomiarowy 3D ECT składa się z elektrod, układów akwizycji danych oraz komputera sterującego pomiarem i przetwarzającego dane. Ze względu na bezkontaktowe działanie ECT jest metodą nieinwazyjną. Pomiar, wymaga wstępnej kalibracji, aby zniwelować efekty pojemności pasożytniczej i określić różnice między niezależnymi układami pomiarowymi. Podczas wielokanałowej sekwencji pomiarowej jedna elektroda jest pobudzana źródłem napięcia zmiennego w quasi-elektrostatycznym reżimie, zwykle poniżej 10 MHz (tzw. metoda AC) lub sygnałem prostokątnym, zwykle trwającym kilkanaście mikrosekund (metoda impulsowa), podczas gdy pozostałe elektrody są umieszczone na potencjale ziemi i służą do pomiaru wynikowego prądu. Ten proces jest powtarzany dla wszystkich możliwych par elektrod. W rezultacie, dla systemów 3D ECT z N liczbą kanałów pomiarowych, liczba niezależnych pomiarów jest równa N(N-1)/2. Proces ten jest zwykle automatyzowany przez układy akwizycji danych.