W związku ze zmianą działu administracji rządowej gospodarka złożami kopalin na dział gospodarka surowcami energetycznymi, od 6 lipca 2024, z mocą wsteczną od 1 lipca 2024, nastąpiła odpowiednia zmiana zakresu działania ministerstwa..
24 lipca 2025 w wyniku zmian w trzecim rządzie Donalda Tuska została odwołana minister Marzena Czarnecka. Jej kompetencje przejął nowo powołany minister energii Miłosz Motyka. Ministerstwo nie zostało jednak wówczas zlikwidowane, pozostawiając obsługę ministra właściwego do spraw działu administracji rządowej: gospodarka surowcami energetycznymi.. Oficjalnie zostało zlikwidowane 21 sierpnia 2025, a jego kompetencje przejęło nowo utworzone Ministerstwo Energii.
Kierownictwo (na dzień zniesienia ministerstwa) Miłosz Motyka (PSL) – minister energii od 24 lipca 2025. Wojciech Wrochna – sekretarz stanu, pełnomocnik Rządu ds. strategicznej infrastruktury energetycznej od 12 listopada 2024 Rafał Michał Tomasik – dyrektor generalny