Sanktuarium św. Andrzeja Boboli w Warszawie – sanktuarium pod wezwaniem św. Andrzeja Boboli znajdujące się przy ul. Rakowieckiej 61 róg ul. św. Andrzeja Boboli w Warszawie, w dzielnicy Mokotów.
Sanktuarium zbudowane zostało w latach 1980–1989, wcześniej był tam ogród ojców jezuitów oraz kaplica, gdzie od 1938 przechowywano relikwie Andrzeja Boboli.
Historia 1 grudnia 1935 roku przy ulicy Rakowieckiej 61 na warszawskim Mokotowie otwarto Dom Pisarzy Towarzystwa Jezusowego, którego fundatorem był papież Pius XI. Relikwie Andrzeja Boboli umieszczono tam 20 czerwca 1938 roku.
W czasie obrony Warszawy we wrześniu 1939 roku trumna z relikwiami Andrzeja Boboli z pomocą żołnierzy wojsk lotniczych kwaterujących przy ul. Rakowieckiej została przewieziona na Stare Miasto.
2 sierpnia 1944 roku, w drugim dniu powstania warszawskiego, w podziemiach Domu Pisarzy Niemcy zamordowali 44 Polaków, w tym 8 kapłanów i 8 braci Towarzystwa Jezusowego oraz 28 osób świeckich. Po wojnie pokój w którym dokonano masakry został przekształcony w kaplicę, a szczątki ofiar pogrzebano pod posadzką jego podłogi.