Klimat thumb|Krajobraz Półwyspu Çeleken położonego u południowego wybrzeża Zatoki Turkmenbaszy (2018) Na obszarze rezerwatu występuje klimat kontynentalny z dużymi dobowymi wahaniami temperatury oraz niskim poziomem opadów (ok. 100–120 mm rocznie). Średnia roczna temperatura wynosi 15,8 °C (średnia miesięczna temperatura w styczniu to –4 °C, a w lipcu +28 °C), zanotowane maksimum wynosi +47 °C, a minimum to –21 °C. Przeważają wiatry północno-zachodnie przynoszące latem chłód a zimą mrozy. Wiatry południowo-wschodnie są rzadsze; niosą one ciepłe powietrze zimą, zaś latem skutkują bardzo upalną pogodą.
Flora W wodach zatok występuje duża różnorodność makrofitów obejmujących 28 gatunków zielenic, 11 gatunków krasnorostów i jeden gatunek brunatnicy; gromadzą się one wzdłuż wybrzeża oraz na głębokościach dochodzących do 6 m. W planktonie i bentosie występują setki gatunków mikroskopijnych okrzemków, sinic i bruzdnic.
Na terenie rezerwatu i terenów bezpośrednio doń przylegających stwierdzono występowanie 416 gatunków roślin naczyniowych, spośród których 6 gatunków figuruje w turkmeńskiej Czerwonej Księdze z 2011 roku jako gatunki rzadkie – , , , i .