Informacja o jej zwolnieniu w kwietniu 2024 z pełnionej funkcji wywołała sprzeciw środowiska konserwatorskiego, w tym krytykę ze strony poprzedniego kierownictwa ministerstwa. W październiku tego samego roku decyzja ministra o zwolnieniu Doroty Janiszewskiej-Jakubiak została uchylona przez wojewódzki sąd administracyjny.
Współpraca Jest autorką oraz redaktorką publikacji, organizatorką konferencji, a także konsultantką wystaw i filmów. Członkini Kapituły Nagrody „Przeglądu Wschodniego”, Rady Muzeum im. Kazimierza Pułaskiego w Warce, Rady Muzeum Azji i Pacyfiku w Warszawie, Międzynarodowego Centrum Kultury.
Jest członkiem Rady Redakcyjnej „Cenne, Bezcenne / Utracone” (Narodowy Instytut Muzeów), Rady Naukowej czasopisma naukowego „KonserwacjaWro. Szkło. Witraż. Ceramika” (ASP we Wrocławiu). Jako autorka artykułów współpracuje m.in. z portalem PAP dzieje.pl oraz portalem Instytutu Polonika „Dziedzictwo za granicą. Baza poloników”.
Odznaczenia 2013 – brązowy Medal „Za zasługi dla obronności kraju” 2013 – Krzyż Uznania (łot.