Ze względu na wpływ ciepłego Prądu Mozambickiego (będącego odgałęzieniem Prądu Południoworównikowego) krystalicznie czyste wody wokół archipelagu cechują się bardzo dużą różnorodnością biologiczną. Występują tu rozległe rafy koralowe zajmujące obszar 525 km², zasiedlone przez 160 gatunków reprezentujących 55 rodzajów koralowców, podwodne łąki trawy morskiej (ang. seagrass meadows), które tworzy m.in. , i , natomiast wybrzeża wysp porastają gęste lasy namorzynowe, najliczniej tworzone przez , , , Rhizophora mucronata, i .
Występuje tu ok. 350 gatunków ryb oraz 4 zagrożone wyginięciem gatunki żółwi morskich – karetta (Caretta caretta), żółw szylkretowy (Eretmochelys imbricata), żółw jadalny (Chelonia mydas) i żółw oliwkowy (Lepidochelys olivacea) – oraz żółw skórzasty (Dermochelys coriacea). Płytkie wody przybrzeżne zamieszkują również ślimaki morskie, m.in. przyłbica rogata (Cassis cornuta), (Tridacna squamosa), oraz .