W 1990 został awansowany na stanowisko szefa oddziału w Zarządzie Operacyjnym Głównego Zarządu Szkolenia Bojowego WP, a następnie objął funkcję szefa oddziału w Zarządzie Szkolenia Operacyjnego Sztabu Generalnego WP. Był w zespole, który przygotowywał przystąpienie Polski do NATO, tworzył i realizował program „Partnerstwo dla Pokoju”. W okresie tym za przygotowanie tego programu odpowiadał Sztab Generalny WP, gdzie powstał zespół do opracowania planu udziału w nim sił zbrojnych, na którego czele stanął szef Zarządu Szkolenia Operacyjnego gen. bryg. Władysław Saczonek, a sekretarzem zespołu był płk Janusz Jakubowski. W 1995 przeszedł do Nadwiślańskich Jednostek Wojskowych, gdzie objął stanowisko Komendanta Centralnego Ośrodka Szkolenia w Katowicach. W 1996 na tym stanowisku był awansowany na stopień generała brygady przez prezydenta RP Aleksandra Kwaśniewskiego. W 1998 został skierowany do Warszawy, gdzie objął stanowisko zastępcy dowódcy-szefa logistyki Nadwiślańskich Jednostek Wojskowych w Warszawie. W 2000 po 31 latach służby zakończył zawodową służbę wojskową. W latach 2001–2006 po przejściu w stan spoczynku był doradcą Szefa Obrony Cywilnej Kraju. Od 2009 jest członkiem Klubu Generałów Wojska Polskiego.