Gruzja nie uczestniczyła w podziale Floty Czarnomorskiej ZSRR pomiędzy Rosję, która przejęła większość floty, a Ukrainę. Dopiero w drugiej połowie lat 90. Gruzja otrzymała lub zakupiła kilka niewielkich okrętów, zarówno dla sił morskich, jak i straży granicznej, od Ukrainy, a także innych państw regionu. Większa pomoc zagraniczna była udzielana w zakresie Straży Granicznej. W 1998 roku misję łącznikowo-szkoleniową wysłał do Gruzji amerykański Coast Guard. Jednostki Straży Wybrzeża otrzymywały numery burtowe z prefiksem P, przy tym zasady numeracji zmieniały się.

Jednymi z jej pierwszych jednostek patrolowych o większej wartości były dwa poradzieckie patrolowce projektu 1400 (Zhuk) (P-206 i 207). W 1998 roku Straż Wybrzeża otrzymała swój największy okręt patrolowy „Aieti” (P-22) (były niemiecki trałowiec typu Lindau). Następnie doszły dwa kutry patrolowe typu Dauntless i dwa amerykańskie patrolowce Coast Guardu typu Point. Przed 2008 roku wcielono także okręt patrolowy „Giorgi Toreli” (P-21) radzieckiego projektu 205P i kilka nowych jednostek, w tym szybki kuter „Sokhumi” (P-24). Okręty te uzbrojone były jedynie w broń maszynową, niektóre w małokalibrowe działka.