Amnesty International potwierdziło, że Pegasusa użyto przeciwko Krzysztofowi Brejzie (Brejza miał być inwigilowany w czasie kampanii wyborczej przed wyborami parlamentarnymi w 2019 roku, w czasie kampanii pełnił funkcję szefa sztabu wyborczego Koalicji Obywatelskiej), a ponadto potwierdziło ślady prób zainfekowania Pegasusem na telefonach Ryszarda Brejzy (prezydent Inowrocławia i ojciec Krzysztofa Brejzy) i Magdaleny Łośko (asystentka Krzysztofa Brejzy).
W 2022 roku w Parlamencie Europejskim powołano komisję śledczą ds. zbadania stosowania oprogramowania Pegasus i równoważnego oprogramowania szpiegowskiego służącego inwigilacji. Według raportu końcowego tej komisji użycie Pegasusa należy postrzegać jako część kryzysu praworządności związanego z rządami Prawa i Sprawiedliwości, korzystanie z tego oprogramowania pozwoliło partii rządzącej na nadzór opozycji i krytyków rządu dla celów politycznych, zaś dane z użyciem Pegasusa posłużyły do krytyki opozycji za pośrednictwem mediów publicznych.
17 stycznia 2024 Sejm RP powołał komisję śledczą ds. czynności operacyjno-rozpoznawczych z użyciem Pegasusa. Zakres prac komisji objął okres od 16 listopada 2015 do 20 listopada 2023. Na czele komisji stanęła Magdalena Sroka.