Rozgrywka W Katana Zero gracz jednym ciosem zabija i od jednego ciosu ginie. Przez to rozgrywka jest szybka i dynamiczna, a wszelkie zawahanie gracza może grozić powrotem do początku poziomu. Główną bronią jest katana, którą można odbijać pociski. Broń dostępna jest w 6 wariantach: podstawowa katana, Prism Sword (krew staje się kolorowa), Sword of Masters (miecz strzela wiązką energii), Claymore Prototype (umożliwia przebicie przez tarczę), Phoenix Edge (miecz strzela ogniem) i Savant Knife (umożliwia szybsze zadawanie ciosów). Dodatkowo można znaleźć liczne przedmioty do rzucania jak butelki, noże czy granaty dymne. Jest też możliwość spowolnienia czasu.
Muzyka Ważną rolę w całej grze odgrywa muzyka. Główny bohater przed rozpoczęciem każdego poziomu włącza walkmana i zakłada słuchawki. Utwory są w większości energiczne, dopasowane do dynamicznej rozgrywki. Na platformie Steam można kupić całą ścieżkę dźwiękową osobno.