U młodych okazów powierzchnia całkowicie omszona, potem w dolnej części gładka, błyszcząca, biaława. Pochwa wysoka, błoniasta, workowata, cienka, na zewnętrznej stronie omszona. Miąższ Dość cienki, w kapeluszu biały do jasnoszarego, w trzonie żółtoochrowy o aromatycznym, ziołowym zapachu i niezbyt przyjemnym smaku. Cechy mikroskopowe Zarodniki 5,5–7,5(–8,5) x 3–4,5 µm, elipsoidalne lub nieco cylindryczne. Cheilocystydy i pleurocystydy 40–100 × 10–30(–50) µm, maczugowate, workowate lub butelkowate. W skórce kapelusza strzępki złożone z krótkich komórek o szerokości 10–30 µm z wewnętrznym, szarobrązowym pigmentem. Strzępki na szczycie łuseczek i kosmków cieńsze, o cylindrycznych komórkach mających długość do 230 µm. Gatunki podobne Charakterystycznymi cechami pochwiaka myszatego są: niewielkie rozmiary, szarawy kapelusz i pochwa oraz stosunkowo długie zarodniki. Podobny pochwiak karłowaty (Volvariella pusilla) jest dużo mniejszy, i ma szeroko elipsoidalne owocniki. Okazy pochwiaka myszatego o białej barwie mogą być mylone z pochwiakiem drobnym (Volvariella hypopithys), ale odróżnia się on całkowicie omszonym trzonem i drobniejszymi rozmiarami.