9 września 1990 w Hajnówce miał miejsce chrzest na basenie miejscowego Ośrodka Sportu i Rekreacji, który przyjęło także 5 osób z Białegostoku.
Końcem września białostocka wspólnota skupiała 25 członków. Nabożeństwa zostały wówczas przeniesione do kaplicy należącej do zboru Zrzeszenia Wolnych Badaczy Pisma Świętego. Postanowiono wtedy także o przekształceniu placówki w samodzielny zbór.
W celu wybrania pełniącego obowiązki pastora nowej jednostki, 30 września 1990 w kaplicy Badaczy Pisma Świętego odbyło się zgromadzenie członkowskie przyszłego zboru, w którym udział wzięło 19 wiernych placówki, jak również pastor Jerzy Szpilko ze zboru w Hajnówce jako jej jednostki macierzystej, a także dwóch członków hajnowskiej rady starszych. W spotkaniu uczestniczył również pastor Bolesław Osieczko ze zboru w Przemyślu jako reprezentant Naczelnej Rady Kościoła. Podczas głosowania rozważane były kandydatury Jana Budnika z Białegostoku i Stefana Filipowicza z Hajnówki. Ostatecznie pełniącym obowiązki pastora zboru w Białymstoku został Stefan Filipowicz.