Corputius brał udział w holenderskiej wojnie o niepodległość jako kapitan artylerii od około 1578 roku. Początkowo powierzono mu rozbudowę fortyfikacji Aalst. Odegrał ważną rolę u boku hrabiego Rennenberg, , podczas oblężenia Deventer w tym roku. Rennenberg odnotował na piśmie rangę i funkcję Corputiusa. Nazywał go swoim kapitanem i fortyfikatorem, czyli budowniczym twierdzy. Miasto zostało zdobyte, między innymi dzięki służbom inżynieryjnym Corputiusa. Według projektów Corputiusa wokół miasta zbudowano nowe umocnienia, co uniemożliwiło zaopatrzenie miasta z zewnątrz. Proponował budowę okopów, odprowadzających wodę z fosy miejskiej i ostatecznie podważających jej fortyfikacje.
Później został gubernatorem w Coevorden. Jego zadaniem była rozbudowa tamtejszych fortyfikacji. Opracowany przez niego plan został zatwierdzony przez Stany Generalne. Początkowo jednak można było położyć jedynie fundamenty pod pięć bastionów zaplanowanych przez Corputiusa. Ukończono jedynie dwa bastiony. Dopiero później ukończono fortyfikacje w Coevorden pod hiszpańskim przywództwem na podstawie prac przygotowawczych przeprowadzonych przez Corputiusa.