Tego samego dnia objął funkcję przewodniczącego nowego ciała partyjnego – komitetu wykonawczego, wybierany ponownie na tę funkcję 23 listopada 2013 i 11 września 2016, kiedy to został również wiceprezesem partii. 11 stycznia 2018 ustąpił z funkcji przewodniczącego KW PiS.
W 2005 z listy PiS został wybrany na posła V kadencji w okręgu szczecińskim liczbą 14 731 głosów. W 2007 po raz drugi uzyskał mandat poselski, otrzymując 33 237 głosów. Kandydował także w wyborach parlamentarnych w 2011 i po raz kolejny uzyskał mandat poselski zdobywając 38 700 głosów.
Również w 2015 z powodzeniem ubiegał się o poselską reelekcję (dostał 46 918 głosów). Na pierwszym posiedzeniu Sejmu VIII kadencji, 12 listopada 2015, został wybrany na wicemarszałka SejmuUchwała Sejmu Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 12 listopada 2015 r. w sprawie wyboru wicemarszałka Sejmu ().. 9 stycznia 2018 mianowany na ministra spraw wewnętrznych i administracji w rządzie Mateusza Morawieckiego. Tego samego dnia zrezygnował ze stanowiska wicemarszałka SejmuJoachim Brudziński zrezygnował z funkcji wicemarszałka Sejmu 9 stycznia 2018.