thumb|Kozacy zaporoscy w czajce podczas sztormu na obrazie Ilji Riepina Bałtycka flotylla kozacka – flotylla w służbie Rzeczypospolitej utworzona w 1635 roku z Kozaków zaporoskich do działań bojowych na Morzu Bałtyckim.
Geneza Pierwsza połowa XVII wieku upłynęła w Europie pod znakiem wojny trzydziestoletniej. Jednocześnie Rzeczpospolita znajdowała się w stanie ciągłego konfliktu zbrojnego ze Szwecją o panowanie nad południowo-wschodnim wybrzeżem Morza Bałtyckiego. Kolejna wojna polsko-szwedzka zakończyła się w 1629 roku rozejmem w Altmarku, którego okres obowiązywania kończył się w 1635 roku. Wojska polsko-litewskie miały przewagę na lądzie, ale na morzu dominowała flota szwedzka. Swoimi desantami uniemożliwiła wojskom polsko-litewskim zdobycie przyczółka na wybrzeżu i utrzymała pod kontrolą pruskie porty. Nowo utworzona regularna polska marynarka wojenna, po kilku morskich bitwach była mocno osłabiona. Pamiętając o wyczynach Kozaków na Morzu Czarnym (chadzki kozackie), zasugerowano królowi Polski Władysławowi IV Wazie użycie flotylli kozackiej przeciwko Szwedom na Morzu Bałtyckim.