Drużyny z 1A. DOL do rozgrywek dołączyły w 1/8 finału, natomiast cztery najlepsze zespoły z 1B. DOL (biorąc pod uwagę wyniki z sezonu 2023/2024) – w 4. rundzie. Przed 3. rundą odbyło się losowanie wyłaniające pary meczowe oraz drabinkę turniejową obejmującą również 1/8 finału. Kolejne losowanie miało miejsce przed ćwierćfinałami, na podstawie którego powstała drabinka na dalszą część rozgrywek. Finaliści Pucharu Słowenii w sezonie 2023/2024 zostali rozstawieni i mogli na siebie trafić najwcześniej w finale.
We wszystkich rundach o awansie w parze decydował jeden mecz. Gospodarzem meczu w parze była drużyna z niższej ligi lub, jeżeli oba zespoły grały na tym samym poziomie rozgrywkowym, ta która zajęła niższe miejsce w rozgrywkach ligowych w poprzednim sezonie.