Filogeneza i ewolucja Filogenetyczne relacje pomiędzy piórami morskimi określane są jako „dalekie od rozwiązania” – nie wiadomo, jak one wyewoluowały ani jakie są relacje między gatunkami. Jedno z pierwszych badań skupiających się na Pennatulacea wykazało, że w tradycyjnym ujęciu są one polifiletyczne. Zarówno molekularne, jak i morfologiczne analizy nie pozwoliły na ustalenie adekwatnej klasyfikacji tych zwierząt. U większości taksonów brakuje cech morfologicznych nadających się do wykorzystania w analizie filogenetycznej, dodatkowo materiał badawczy (form głębinowych) jest trudny do pozyskania. Analizy filogenetyczne na podstawie sekwencjonowania białek mutS-like oraz ND2 podjednostki 2 dehydrogenazy NADH wykazały, że wraz z są polifiletyczne, także , oraz nie są taksonami monofiletycznymi. Badania te wskazały i jako grupy bazalne oraz istnienie w obrębie rzędu czterech dużych kladów (nie odpowiadających tradycyjnym podziałom).
Dotychczas najbardziej wyczerpujące opracowanie klasyfikacji Pennatulacea stanowi publikacja Kükenthala z 1915.