Gdy w 2013 roku HMV zamknął 81 swoich sklepów z powodu kłopotów ze sprzedażą, miesięcznik popadł w kłopoty. Jego nakład spadł ze 100 630 egzemplarzy w lutym do 55 580 w czerwcu. Na tym gwałtownym spadku skorzystał miesięcznik Mojo wyprzedzając The Fly i stając się tytułem muzycznym nr 1 pod względem nakładu – sprzedawany w cenie 4,60 funta z egzemplarz odnotował miesięczną sprzedaż na poziomie 79 345 egzemplarzy w pierwszej połowie roku, w porównaniu ze średnią The Fly wynoszącą 70 866 bezpłatnych egzemplarzy. Ale pomimo zdobycia tytułu największego magazynu muzycznego, sprzedaż Mojo też spadła – o 5,2% w porównaniu z ostatnią połową ubiegłego roku i o 6,8% w porównaniu z pierwszymi sześcioma miesiącami 2012 roku. Spadek sprzedaży odnotowały również inne znaczące tytuły muzyczne jak Q, Kerrang i NME.
W marcu 2014 roku wydawca i właściciel The Fly, Mama Group podjął decyzję o jego zamknięciu, przy jednoczesnym kontynuowaniu działalności online. W krótkim oświadczeniu opublikowanym na swojej stronie internetowej wydawca stwierdził, że własność „marek cyfrowych i internetowych” przejdzie na długoletniego redaktora magazynu, JJ Dunninga.