Zgodnie z przeprowadzonym później dochodzeniem przyczyną pożaru miało być „zatrzymanie się pasa w elewatorze młyna żytniego, który w dniu wybuchu pożaru był nieczynny – mimo tego nie wyłączono transmisji”. Jednocześnie wykryto wiele innych uchybień towarzyszących funkcjonowaniu młyna w poprzedzającym katastrofę okresie: produkcja mąki poniżej określonych norm, wydawanie pracownikom mąki poza deputatami oraz ukrywanie zapasów mąki i zboża. Doprowadziło to do aresztowania dyrektora, dwóch kierowników technicznych oraz trzech młynarzy. Zajmowano się także kwestią „działania na szkodę Państwa” przez bialskie władze samorządowe, którym zarzucano, że przez półtora roku nie dokonały naprawy połączenia wodociągowego z Bielskiem zniszczonego przy wysadzeniu mostu Monniera (w ciągu ulicy Mostowej) w lutym 1945, co tym bardziej utrudniło akcję gaśniczą. Aresztowano kierownika oddziału wodociągów w Zarządzie Miejskim, a na krótko również samego burmistrza Białej Franciszka Hrapkowicza i jego zastępcę Rudolfa Klimczaka.