Gdy beznadziejność ich sytuacji staje się oczywista, większość dorosłych popada w obłęd. Dostawca Sekiya gromadzi zapasy żywności szkoły i składa w ofierze nauczycieli, którzy próbują go powstrzymać, ale zostaje obezwładniony przez klasę Sho. Tymczasem nauczyciel Wakahara morduje swoich współpracowników oraz kilkoro uczniów, zanim zostaje zabity przez Sho w obronie własnej. Gdy wszyscy dorośli, poza Sekiyą, nie żyją, Sho i jego towarzysze próbują stworzyć coś na kształt quasi-rządu, aby przewodzić dzieciom. Nishi, uczennica ze zdolnością telepatii, nawiązuje kontakt z Emiko, która w swojej epoce przygotowuje przedmioty mające pomóc dzieciom przetrwać w przyszłości.
Uwięzione dzieci stawiają czoła wielu zagrożeniom w walce o przetrwanie, w tym wrogiej megafaunie, śmiertelnej zarazie, niedoborom jedzenia i wody, buntownikom siejącym niezgodę oraz postępującemu szaleństwu. Dodatkowo muszą zmierzyć się z sadystycznymi intrygami Sekiyi, którego zdrowie psychiczne stopniowo się pogarsza.