Przed modyfikacją przez człowieka las zajmował około 17% powierzchni Brazylii. W latach czterdziestych XX wieku Brazylia rozpoczęła program rozwoju narodowego w dorzeczu Amazonki. Brazylia miała najwyższy wskaźnik wylesiania na świecie — w 2005 roku miała największą powierzchnię lasów usuwaną rocznie. Od 1970 roku zniszczono ponad lasu deszczowego Amazonii. W 2001 roku Amazonia miała około , co stanowiło tylko 87% pierwotnej wielkości Amazonii. Według oficjalnych danych około 729 000 km² zostało już wylesionych w biomie Amazonii, co odpowiada 17% całości. 300 000 km² zostało wylesionych w ciągu ostatnich 20 lat.
Lasy deszczowe zmniejszyły swoją powierzchnię głównie z powodu wylesiania. Między majem 2000 a sierpniem 2006 roku Brazylia straciła prawie lasu, obszar większy niż Grecja. Według raportu Living Planet Report z 2010 roku wylesianie nadal postępuje w alarmującym tempie. Podczas 9. Konferencji Konwencji o różnorodności biologicznej 67 ministrów zobowiązało się do osiągnięcia zerowego netto wylesiania do 2020 roku. Z powodu wylesiania Amazonia była emitentem netto gazów cieplarnianych w latach 2010-tych.