Wraz z Wojciechem Kwiatkowskim pracę w szkole od września 1945 rozpoczęła pierwsza nauczycielka – Zuzanna Cieszkowska, posiadająca również kwalifikacje nauczycielskie. Następnie od stycznia 1946 rozpoczęła pracę Maria Paterek i od marca Jadwiga Stasiunowa. Po repatriacjach ludności z Kresów do Braniewa w roku 1946 skokowo zaczęła rosnąć w szkole liczba zarówno uczniów, jak i nauczycieli. W październiku 1946 w szkole pracowało już siedmiu nauczycieli i uczyło się 304 uczniów. W kolejnym roku, 1947, pracowało w szkole już dwunastu nauczycieli i było 524 uczniów. W 1950 uczniów było 780 i pracowało 17 nauczycieli.
Naukę rozpoczęto w 1945 roku, tj. w pierwszym roku szkolnym, w przedwojennym budynku Szkoły Rolniczej, który najmniej ucierpiał ze wszystkich szkół w mieście. Jednak ten niezaduży obiekt posiadał zaledwie kilka klas szkolnych, gdyż przeznaczony był do kształcenia dwuletniego, a oddziałów szkoły podstawowej miało powstać siedem, bo tyle klas liczyła wówczas szkoła podstawowa (aż do roku 1965). Zatem istniała pilna potrzeba zaadaptowania na szkołę znacznie większego obiektu. Naturalnym wyborem był dużo większy gmach przedwojennej szkoły Doppelschule, położony zresztą nieopodal, u zbiegu współczesnej ul. Armii Krajowej i Konarskiego.