Praca naukow0-dydaktyczna Jan Dobrowolski na początku lar 60. XX w. był inicjatorem badań naukowych nad zastosowaniem regulatorów wzrostu roślin, nad enzymami roślin i zwierząt, a także prowadził badania nad chemomutagenezą pszenicy. Opublikował 30 prac naukowych, a także wiele prac popularnonaukowych i referatów z zakresu analizy chemicznej i biochemicznej, a ponadto 5 podręczników z chemii analitycznej i 2 z biochemii. Wypromował 7 doktorów i 45 magistrów inżynierów, recenzował 25 prac doktorskich, 2 prace habilitacyjne oraz 5 wniosków o nadanie tytułu profesora.
Praca organizacyjna Jan Dobrowolski w latach 1962–1964 pełnił funkcję prodziekana Wydziału Rolniczego WSR w Szczecinie. Był redaktorem naczelnym wydawnictw naukowych Akademii Rolniczej w Szczecinie (1974–1978)Jadwiga Trzebiatowska. Działalność wydawnicza. W: „50 lat Akademii Rolniczej w Szczecinie. Praca pod redakcją Lecha Pałasza. Szczecin, Akademia Rolnicza w Szczecinie 2004”, s.302-305. ISBN 83-7317-125-8 (dostęp 19.02.2025), przewodniczącym Oddziału Szczecińskiego Polskiego Towarzystwa Chemicznego (1962–1964), przewodniczącym Oddziału Szczecińskiego Polskiego Towarzystwa Biochemicznego (1964–1966), zastępcą przewodniczącego Wydziału II Szczecińskiego Towarzystwa Naukowego (1968–1970), twórcą Szczecińskiego Oddziału Polskiego Towarzystwa Biofizycznego.