Następnie zorganizowała ucieczkę trojga dzieci do Warszawy. Sama Banasiak również próbowała przedostać się do Generalnego Gubernatorstwa, jednak 22 listopada 1943 roku została zatrzymana w Kutnie przez gestapo.
Po zatrzymaniu była przesłuchiwana w Łodzi i Toruniu. Na wniosek sekretarza kryminalnego Siedlera 1 lipca 1944 roku trafiła do obozu koncentracyjnego Stutthof. Została zarejestrowana pod numerem 37323. W obozie uczestniczyła w samopomocy oraz pracowała jako sanitariuszka. Chcąc pomóc chorym na dur brzuszny nie zdecydowała się na wzięcie udziału w ewakuacji obozu w styczniu 1945 roku. 23 kwietnia 1945 roku została ewakuowana w ostatnim transporcie barkami, gdzie dotarła do Flensburga. 9 maja transport został przejęty przez Szwedzki Czerwony Krzyż. 12 maja Banaszek dostała się do Malmö. 16 maja zachorowała na dur brzuszny. Zmarła 3 czerwca, została pochowana na cmentarzu w Malmö.