Z armią Hallera uczestniczył w wyprawie kijowskiej oraz w uroczystości zaślubin Polski z morzem w Pucku w 1920 roku, na którą skomponował "Poloneza na zaślubiny Polski z Bałtykiem".
W okresie międzywojennym Fyda intensywnie komponował i prowadził działalność muzyczną. Współpracował z Towarzystwem Dramatycznym w Nowym Sączu, pisał muzykę do przedstawień teatralnych, tworzył i prowadził lokalne orkiestry. Jednym z jego znaczących utworów z tego okresu jest "Marsz żałobny z okazji śmierci Józefa Piłsudskiego" (1935).
II wojna światowa W 1942 roku został aresztowany wraz z synem Karolem i osadzony w obozie koncentracyjnym Auschwitz, gdzie grał w orkiestrze obozowej. Następnie został przeniesiony do obozu Sachsenhausen, gdzie prawdopodobnie pełnił funkcję kapelmistrza lub zastępcy kapelmistrza orkiestry obozowej. Zginął w 1944 roku podczas nalotu alianckiego na obóz.
Twórczość Muzyka Jana Karola Fydy łączy elementy tradycyjnych rytmów, inspiracje muzyką wiedeńską i twórczością Straussa oraz motywy ludowe, chóralne, klasyczne i wojskowe. Jego kompozycje oddają klimat lat 20. i 30. XX wieku. Do najważniejszych utworów należą: