Kościół kilkakrotnie przebudowywano: w XV wieku nadano mu formy gotyckie, w 1571 przeprowadzono restaurację. W 1611 r., od uderzenia pioruna, kościół częściowo spłonął. W 1619 w Sobocie osiedlili się szwenkfeldyści, mieszkający tam aż do 1726. W 1654 kościół zwrócono katolikom. Po pożarze wywołanym uderzeniem pioruna w 1670 roku odbudowano go w latach 1701–1708. Z tego okresu pochodzi dobudowana kruchta z barokowym portalem.
Podczas II wojny światowej, w 1945 roku, świątynia została zbombardowana przez Armię Czerwoną, gdyż Niemcy urządzili w wieży punkt obserwacyjny. Od tamtej pory pozostaje w ruinie. W 2012 roku przeprowadzono prace porządkowe i zabezpieczające z inicjatywy Starostwa Powiatowego w Lwówku Śląskim.
Architektura
Sytuacja i otoczenie Kościół usytuowany jest na wzgórzu, w północnej części wsi Sobota, naprzeciwko nowego kościoła, przy skrzyżowaniu lokalnych dróg powiatowych. Otoczony jest wysokim, obronnym murem z kamienia łamanego, który przypomina bardziej mury warowni niż ogrodzenie sakralne. Przy południowym wejściu znajduje się budynek bramny, a wokół świątyni rozciąga się dawny cmentarz.