W 1998 roku resort utracił swoją samodzielność – połączono go z Federalnym Ministerstwem Transportu, tworząc Federalne Ministerstwo Transportu, Budownictwa i Mieszkalnictwa. Od 2013 roku zadania budownictwa i rozwoju miast zostały przeniesione do Federalnego Ministerstwa Środowiska, a następnie w 2018 roku do Federalnego Ministerstwa Spraw Wewnętrznych, Budownictwa i Ojczyzny.
W 2021 roku, wraz z rozpoczęciem 20. kadencji Bundestagu, zadania te zostały ponownie skonsolidowane w nowo utworzonym Federalnym Ministerstwie Mieszkalnictwa, Rozwoju Miast i Budownictwa.
Struktura i działania Ministerstwo dzieli się na cztery główne departamenty oraz sztab kierowniczy:
Leitungsstab (Sztab Kierowniczy)
Sztab odpowiada za planowanie, koordynację i komunikację w zakresie wszystkich kwestii politycznych. Do jego zadań należy obsługa spraw rządowych i parlamentarnych, polityka informacyjna i medialna, zarządzanie wydarzeniami oraz odpowiedzi na zapytania obywateli w kwestiach polityki wewnętrznej.
Abteilung Z (Departament Centralny i Strategiczny)