Po wojnie w Górskim Karabachu (1991–1994), w wyniku której obszar ten znalazł się pod kontrolą sił ormiańskich, badania w jaskini zostały wznowione w 2001 roku przez międzynarodowy zespół badawczy, w skład którego wchodzili naukowcy z Armenii, Wielkiej Brytanii, Hiszpanii i Irlandii. Według raportów organizacji Monument Watch, podczas konfliktu w Górskim Karabachu w 2020 roku, jaskinia i jej okolice mogły być wykorzystywane do celów wojskowych, co mogło narazić stanowisko archeologiczne na uszkodzenia. Po odzyskaniu przez Azerbejdżan kontroli nad tym terytorium w wyniku wojny w 2020 roku, Ministerstwo Kultury Azerbejdżanu ogłosiło plany wznowienia badań naukowych w jaskini.
Znaleziska archeologiczne Jaskinia Azıx dostarczyła niezwykle bogatego materiału archeologicznego. W najniższych warstwach (X-VII) odkryto prymitywne narzędzia kamienne, które mogą należeć do kultury olduwajskiej. Warstwa VI dostarczyła licznych narzędzi kultury aszelskiej, w tym pięściaki, oraz skamieniałe szczątki fauny. Najważniejszym znaleziskiem z tej warstwy jest fragment szczęki hominina Azychantropa (tzw. Człowiek z Azıx), interpretowany jako pozostałość człowieka heidelberskiego lub wczesnego neandertalczyka.